肛門管解剖学
肛門管は下部消化管・大腸の最末端で、下は会陰部の肛門縁、上は直腸に挟まれた部分。 このトピックでは、臨床の場でこの部位が通常どのように診察されるかを示すため、下から上に向かって説明する。 肛門管の画像は以下をご覧ください。
直腸と肛門管の解剖図。 提供：Wikimedia Commons (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Rectum_anatomy_de_01.svg; author Armin Kübelbeck). 
直腸と肛門管の冠状断面図。 
肛門管を通る冠状断面。 臀部の色素沈着し角化した肛門周囲皮膚には皮膚付属器（毛、汗腺、皮脂腺など）があり、肛門縁上の肛門管皮膚は色素沈着し角化するが皮膚付属器はない。
上の直腸と下の肛門管の境界は肛門輪または肛門屈曲部で、恥骨筋が肛門接合部の後面を囲んでスリングを形成し、前方にくびれを作る。 肛門管の長さは約4cm（3～5cm）で、その3分の2はペクチネイトライン（歯状線ともいう）の上にあり、3分の1はペクチネイトラインの下にある。
下の肛門縁と上のペクチネイトライン間の肛門管の上皮は肛門粘膜または肛門皮膚としてさまざまに表現される。
ペクチネートラインは、下方の直腸と上方の後腸の移行部である。 これは肛門柱の最下端にある肛門弁（粘膜の横ヒダ）によって形成されるスカラップ状の境界線である。 肛門腺は肛門弁の上方で肛門洞に開口している。 臨床ではペクチネートラインは確認できないが、麻酔下で肛門管が下降し、肛門管の皮膚を少し引っ込めるとペクチネートラインが確認できる。
ペクチネートラインのすぐ上、約1～2cmの肛門管は肛門ペクチンまたは移行帯と呼ばれている。 この移行帯より上は、肛門管は柱状上皮（切開に鈍感）で裏打ちされている。 Morgagniの肛門柱は、肛門管の上部にある6～10本の縦長の粘膜ひだである。
これらの柱の下部には肛門洞があり、肛門腺と肛門乳頭はこの中に開いている。 肛門腺への感染は、肛門周囲膿瘍や瘻孔の原因となる最初の出来事であると考えられる。 これらの柱のうち3本（仰臥位で3時、7時、11時の位置にある左外側、右後側、右前側）は、肛門クッションと呼ばれ、上直腸（痔核）動脈と静脈の枝や支流を含んでいるため、顕著である。
肛門接合部あるいは肛門輪は、肛門から約5cmのところにある。 肛門屈曲部では、肛門接合部は恥骨スリングによって前上方に引っ張られ、肛門管として下に続いている。
腹斜筋と尾骨筋が骨盤横隔膜を形成する。 肛門管の外側には、骨盤横隔膜の下、肛門周囲皮膚の上に錐体状の坐骨肛門窩（左右に1つずつ）がある。 一対の坐骨肛門窩は、肛門管の後方で互いに連絡している。 肛門管の前方には、男性では精嚢、前立腺、尿道があり、女性では子宮頸部と膣があり、その間に会陰部がある。 肛門管の前（前方）には直腸窩筋膜（Denonvilliers）、後（後方）には仙骨内膜（Waldeyer）があり、その下には豊富な仙骨静脈叢が存在する。
肛門管は、皮下、粘膜下、括約筋間、坐骨（直腸）、骨盤内といった肛門周囲のスペースに囲まれている。
血液供給とリンパ管
ペクチネイトラインより上の肛門管には、下腸間膜動脈の終末枝である上直腸（痔）動脈が供給されている。
肛門管の皮膚の下（乳頭線より下）には外痔静脈叢があり、全身静脈に流れている。 肛門管粘膜の下（ペクチネイトラインより上）には内痔核静脈叢があり、門脈系に流れている。 したがって、肛門管は門脈系の静脈が接続する重要な部位である（もうひとつは食道胃接合部である）。
生理学
肛門括約筋の緊張は、直腸指診（DRE）の際に、患者に診察指を圧迫させることで評価することができる。
発生学
直腸線より下の肛門は外胚葉から、直腸線より上は後腸の内胚葉から発育している。